Por volta do ano 1000, os índios tapuias que habitavam a região foram expulsos para o interior do continente devido 🧬 à chegada de povos tupis procedentes da Amazônia. No século XVI, quando chegaram os primeiros europeus à região, a mesma 🧬 era habitada pela tribo tupi dos tupinambás.[9]

A cidade foi fundada em apostas de bacará 1557 e cresceu sobre terraços ao lado do 🧬 rio Subaé. Em apostas de bacará 1559, a sesmaria que englobava o atual território de Santo Amaro foi doada a Fernão Rodrigues 🧬 Castelo Branco. No ano seguinte, o mesmo a doou a Francisco de Sá, filho do governador-geral Mem de Sá. Francisco 🧬 construiu o Engenho Real de Sergipe. Francisco morreu antes do pai, que passa para apostas de bacará filha Felipa de Sá.[10]

Felipa de 🧬 Sá vendeu aos monges beneditinos. Em apostas de bacará 1667, monges beneditinos construíram a Capela de Santo Amaro. Felipa de Sá doou 🧬 ainda ao colégio de Santo Antão de Lisboa o Engenho do Conde e nele os Jesuítas construíram a Igreja de 🧬 Nossa Senhora da Purificação em apostas de bacará 1608. Em apostas de bacará 1678 este templo ruiu, em apostas de bacará 18 de Outubro de 1700 🧬 foi realizada uma missa[11] no local que em apostas de bacará 1706, foi iniciada a construção da atual Igreja Matriz de Nossa 🧬 Senhora da Purificação. Foi elevada a vila o município em apostas de bacará 5 de janeiro de 1727. Tornou-se cidade em apostas de bacará 🧬 13 de março de 1837, denominada de "Leal e Benemérita". Em apostas de bacará 1847, foi estabelecida ligação marítima regular com a 🧬 capital da província, Salvador, por navio a vapor. Em apostas de bacará 1855, uma epidemia de cólera dizimou metade da população.[12]

Antes de 🧬 1608, a localidade já era um distrito denominado "Nossa Senhora da Purificação e Santo Amaro". Em apostas de bacará 1727 foi elevado 🧬 à categoria de vila. A lei provincial n.° 43 de 13 de março de 1837 elevou a vila à condição 🧬 de cidade com a denominação de "Santo Amaro".

Já no século XX, em apostas de bacará 1911, o município de Santo Amaro contava 🧬 com sete distritos: Santo Amaro (sede), Bom Jardim, Lustosa, Oliveira dos Campinhos, Rio Fundo, Rosário de Santo Amaro e Saubara. 🧬 Já em apostas de bacará 1933, o número de distrito sobe para oito: Santo Amaro (sede), Bom Jardim, Oliveira dos Campinhos, Nossa 🧬 Senhora do Rosário, Santana do Lustosa, São Bento do Inhatá, São Pedro do Rio Fundo (antes denominado Rio Fundo) e 🧬 Saubara.